薄層掃描儀是可以對斑點進行掃描的分光光度計，用可見光或紫外光作光源，線性掃描或鋸齒掃描薄層板展開后的斑點，該斑點就吸收該組分特征波長的單色光，剩余的單色光經透射或反射或發射熒光，由檢測器積分起來，獲得這塊斑點面積的待測物質含量。